显微图像分析系统可配合各种牌号的普通或荧光显微镜，由高清晰度彩色 CCD即时获得显微图像。运用弱光优化摄影技术可通过长时间曝光使成像质量发生极大飞跃。通过软件可对显微图像进行灵活的调整，并可将图像以照片质量输出。显微图像分析系统对分析对象的定义十分广泛，如：病理组织、细胞(核)结构、染色体核型等。用户可运用软件所提供的几何形态测量、灰度值测量等功能实现对细胞或组织的形态定量、细胞DNA含量的分析、细胞核浆比的测定等实验工作。
该系统采用“高清晰度显微图像获取”和“动、静态双路并行观察技术”，实现对显微细胞图像的全景高解析度图像获取、以及对显微图像的处理和分析。广泛适用于显微细胞图像分析、工业金相组织分析、粉尘颗粒检测、材料显微结构观察等应用领域。
图像获取：根据用户要求选用不同数码CCD、冷CCD相机获取显微图像。
分析软件：复日Smart Scape生物显微图像分析系统软件。
边界增强：可使荧光显微图像中亮度微弱的细胞（核）边缘更清晰。
图像调整：对比度、亮度和色彩平衡调整，可对颜色进行单独提升。
图像滤波器：集成了十余种滤波器可使图像噪声降低。
比例尺：同样放大比例的图像同一个比例尺，测量对象的定量。
直线长度测量：测量显微图像中任意两点间的直线距离。
折线长度测量：对非直线线段进行测量，可获得曲线、周长等数据。
角度测量：可对任意夹角的角度进行测量。
亮度/RGB值测量：对任意点的亮度及RGB值进行测量，并数值化。
亮度曲线：对图像上的线段进行亮度扫描，并通过曲线形式表达出来。
灰度值测量：平均灰度、积分灰度等并与光密度保持线性比例关系。
计数：对分割出的对像进行数量统计，同时自动完成测量对象的标记。
附加工具：对图像进行比例放缩，在图像上绘制箭头、标尺、文字等。
显微图像分析系统主要功能：
1. 几何尺寸检测
点、直线、曲线、圆、椭圆、矩形、任意形的长度、角度、面积、周长等几何参数测量。测量单位微米、毫米、厘米、分米、英寸任选；
2．图象变形及几何矫正
水平镜像、垂直镜像、平移、倾斜，缩放、旋转、透视、漫游、任意、网状变形等；
3．区域选取工具
魔杖、套索、椭圆、矩形、圆形工具、方形工具；
4．区域处理
区域反选，区域扩大，区域缩小，边界圆滑、平移、缩放、旋转、任意变形；
5．图象处理
（1） 色调处理
负象、灰值化、色调调整、颜色平衡、亮度反差调整；
（2） 图增象强
照明场均匀、直方图拉伸、直方图均衡，灰值函数变换等；
（3） 边缘检测
Roberts、Laplace、Kirch、Prewitt、水平、垂直、左45、右45等边缘检测；
（4） 图象平滑
均值、中值、低通滤波等；
（5） 灰值形态学
腐蚀、膨胀、开、闭，开闭、波峰、波谷、形态学梯度、混合滤波等；
（6） 图象常数运算
RGB各通道加、减、乘、除、乘方、指数等运算；
（7） 图象间运算
RGB各通道加、减、乘、除、与、或、非、与非、或非、大、小、距离、特征与等运算；
（8） 其他滤波器
自定义滤波器、马赛克、黑斑去除、黑区增强等；
6．分析目标处理
分析目标扩大，分析目标缩小，边界圆滑、分析目标删除、孔洞填充、内外轮廓抽取、形态学梯度，骨架化，骨架纯化，分支修剪，断点修复等；
7．分析参数(共十一类，包括)
（1） 几何参数
（2） 位置参数
（3） 当量几何参数
（4） 外接几何参数
（5） 光密度参数
（6） 形态学参数
（7） 矩参数
（9） 纹理参数
（10） 孔洞参数
（11） 其他参数
其中个体参数100多项，统计参数100多项，分析参数。总数达10000多项。
9．分析参数可视化处理
分析结果与图象之间直接影射显示。特定目标及其长轴、质心、外接矩形、凸包，编号等抽取显示。分析目标不同透明度颜色叠层显示；
10其他功能
系统还提供了吸管、画笔、填充、直线、移动、剪裁等十多种交互式处理工具；
